實驗室排水系統(tǒng)應(yīng)該根據(jù)相應(yīng)的排出廢水的性質(zhì)、成份和受污程度來進(jìn)行設(shè)置。有害物質(zhì)的排放要符合相應(yīng)的國家標(biāo)準(zhǔn)，因此，對于有害物質(zhì)要先進(jìn)行一定的處理才可排出。甚至要設(shè)置獨立排水的管道進(jìn)行局部處理，方可排入室外的排水管網(wǎng)。而對于一些含有無害的膠狀物體、懸浮物體或設(shè)備冷卻水，因其受污并不嚴(yán)重，可以直接排放到室外的排水管網(wǎng)。但是，如果這些廢水要進(jìn)行重復(fù)使用的話，則要進(jìn)行相應(yīng)的處理。 
排水管道的設(shè)置同樣需要進(jìn)行合理的布局，轉(zhuǎn)角盡量少，以防止雜質(zhì)堵塞，在安排上要相對集中，這樣就便于出現(xiàn)故障后的維修。排管時要盡量沿著走道、柱角、墻壁、天棚等，但要注意，避免穿過精密儀器室等衛(wèi)生安全需求較高的實驗室。主管道應(yīng)盡量安排在靠近雜質(zhì)較多、排水量較大的設(shè)備的位置。